對于合作社收到政府補助款進行賬務處理，首先要明確補助款的來源和支出用途，要仔細記錄每筆賬款的日期、金額和用途，然后在財務會計上按照國家有關規定填報報表，將補助款的收支情況納入合作社賬面計算機制中。

具體賬務處理步驟如下：

1、制定補助款的收支審批程序，審批有關補助款的支出事宜，并維護補助款的收入專戶。

2、在支出前，要檢查補助款來源的合法性，以及使用是否符合補助款的用途規定。

3、補助款收支后，要結賬并制作相應的憑單，以備核對疑問和備查。

4、合作社財務部門要仔細核查收到的政府補助款，并記錄收到的金額、日期和用途,再在財務會計上按照國家有關規定填報報表，將補助款的收支情況納入合作社賬面計算機制中。

拓展知識：此外，合作社還要定期對補助款的收支情況進行報銷，并與政府有關部門進行如實報告，以確保補助款的合理使用，并維護合作社的良好形象。