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根據您提供的信息，退役軍人和重點群體享受的稅收優惠分別為45000元和15600元，共計60600元。在申報表上，附加稅的計算是以抵減后的增值稅為基礎，而不是以60600元為計稅依據。因此，當您的公司抵減了60600元的增值稅時，申報表上的附加稅是以抵減后的增值稅加上45000元作為計稅依據計算出來的。
具體來說，如果您的公司在計算增值稅時已經抵減了60600元，那么附加稅的計算應該是以剩余的增值稅為基礎。由于您享受的稅收優惠是45000元，因此剩余的增值稅應該是60600元減去45000元，即15600元。然后，申報表上的附加稅是以剩余的增值稅15600元加上45000元作為計稅依據計算出來的。