合作社小規模和一般納稅人有很多區別，

首先，小規模納稅人只有在一定的最高銷售額內才能申報認定，而一般納稅人卻不受這樣的限制，一般納稅人的銷售額沒有最高限制，他們只要滿足政府指定的要求就可以成為一般納稅人。

其次，小規模納稅人在適用財務會計制度和會計準則上的選擇也與一般納稅人不同。小規模納稅人適用的會計準則是政府制定的簡單會計準則，及根據簡單會計準則擬定的會計報表，而一般納稅人則是根據會計準則擬定的會計報表，且納稅義務也更重。

再次，小規模納稅人稅收差異性也比一般納稅人大。小規模納稅人在增值稅額的計算上采取的是實際發生額方法，而一般納稅人則采取的是稅收基礎法，其稅收負擔也比小規模納稅人大。

總之，合作社小規模和一般納稅人有許多不同的地方，比如受認定范圍限制，財務會計制度適用范圍和會計準則可供選擇等。

拓展知識：小規模納稅人還具有普惠性稅收減免，比如在某些情況下可免征增值稅和附加稅，而一般納稅人往往不具有這樣的優惠。