總會計師和財務總監的區別如下：

1、主要職責不同：

財務總監的職能主要在于監督，總會計師的職能主要在于管理。總會計師是專業職務，財務總監是行政職務，二者是相輔相存的。

2、主要工作內容不同：

總會計師是單位行政領導成員，協助單位主要行政領導人工作，對單位主要行政領導負責。凡設置總會計師的單位，在單位行政領導成員中，不設與總會計師職權重疊的副職。財務總監主持公司財務戰略規劃的制定，為公司經營決策提供依據，并協助總經理制定公司戰略。

3、兩者起源不同：

財務總監制度起源于二戰前后，西方國家在國有企業中建立財務總監制，監督總經理及經理層，以避免“內部人控制”，保護所有者的利益。