企業微信收入的會計分錄應當分兩步進行：   
1.首先，生成客戶款的收入總賬科目，在客戶款科目中增加金額，借方記入金額，貸方記入應收賬款。   
2.其次，生成企業微信支付賬戶賬簿，客戶支付給企業微信的款項，從企業微信支付賬戶賬簿中增加金額，借方記入金額，貸方記入銀行存款。  
例如，某企業通過企業微信收款1000元，則應在客戶款總賬科目中借1000元，貸1000元應收賬款，同時在企業微信支付賬戶賬簿中借1000元，貸1000元銀行存款。