首先，在處理質量扣款時，要按照合同約定，按照實際發生的情況對質量扣款進行計提和折算，并按照實際發生的情況計入當期利潤表中。其次，對于出口退稅，受影響的直接影響有：一是出口企業收入減少；二是影響出口退稅金額，使出口企業獲得的稅收優惠減少；三是適用抵扣稅和出口抵減稅出口貨物的稅款減少，直接影響出口企業的稅收優惠。最后，增值稅申報受到的影響是：在申報增值稅時，可以把貨物收取的質量扣款計入應稅收入，但是因為出口貨物減免稅所得到的減免稅款小于收入中質量扣款占比，從而使得實際能夠入賬的收入減少，最終影響出口企業增值稅的申報減少。