A公司的股權轉讓所得為12950萬元-5000萬元=7950萬元。A公司在乙公司的投資期間，由于乙公司的增值等原因，A公司可以在股權轉讓時額外獲得一筆投資收益，即7950萬元的股權轉讓所得。 
 
股權轉讓所得稅可分為股權轉讓收益所得稅和被轉讓公司所得稅兩部分，根據《企業所得稅法》規定，股權轉讓收益所得稅稅率為20%，被轉讓公司所得稅稅率為10%。因此，A公司的股權轉讓所得稅應為7950萬元×20%+5000萬元×10%=1665萬元。A公司真正獲得的股權轉讓所得為7950萬元-1665萬元=6285萬元。 
 
拓展知識：股權轉讓所得稅是指在企業股權轉讓中，轉讓方收到的股權轉讓收益和被轉讓公司收到的股權轉讓收入，在稅務機關確認后需要繳納的稅款。