行政事業單位收到利息財務會計和預算會計要按照不同的會計準則進行處理。對于財務會計而言，收到利息應當納入收入類別，然后經過計提收益稅等流程，也可以計提折舊或相關資產賬面價值的減少，最后確認具體的凈利潤數字。而對于預算會計，收到利息應當由國家財政撥款的一部分，將收到的利息計入預算收入中，并與預算支出相抵消，以核實國家財政的資金使用是否合規。 
拓展知識：利息在財務會計中的確認是以權責發生制進行的，收到利息時就認定應記入收入，當發放利息時就認定應記入費用。而預算會計中，利息是收入和支出同時存在，收入和支出合并計入預算收支，實行管理與核算相統一的原則，從而確定預算收支的收入和支出是否符合計劃。