計算處置無形資產的凈損益時，應該考慮處置收到的增值稅。因為增值稅的繳納不僅可以減少企業的費用支出，節約成本，而且也有助于企業增加收入，提升財務收入水平。因此，在計算凈損益時，應將增值稅考慮進去，這樣可以更加客觀地反映處置無形資產的實際收支情況。此外，在處置無形資產時，企業還需要考慮可能產生的附加稅費，如城市維護建設稅、城市房產稅、教育附加費等，如果不考慮這些，也會對最終的凈損益產生較大影響。