您好，一，此時由A企業(yè)提出開具紅字發(fā)票申請單，發(fā)票由A企業(yè)開具。二，此時由B企業(yè)提出開具紅字發(fā)票申請單，發(fā)票由A企業(yè)開具。請參考以下文件。 
國家稅務(wù)總局 
關(guān)于紅字增值稅發(fā)票開具有關(guān)問題的公告 
國家稅務(wù)總局公告2016年第47號 
  為進(jìn)一步規(guī)范納稅人開具增值稅發(fā)票管理，現(xiàn)將紅字發(fā)票開具有關(guān)問題公告如下： 
  一、增值稅一般納稅人開具增值稅專用發(fā)票（以下簡稱“專用發(fā)票”）后，發(fā)生銷貨退回、開票有誤、應(yīng)稅服務(wù)中止等情形但不符合發(fā)票作廢條件，或者因銷貨部分退回及發(fā)生銷售折讓，需要開具紅字專用發(fā)票的，按以下方法處理： 
  （一）購買方取得專用發(fā)票已用于申報抵扣的，購買方可在增值稅發(fā)票管理新系統(tǒng)（以下簡稱“新系統(tǒng)”）中填開并上傳《開具紅字增值稅專用發(fā)票信息表》（以下簡稱《信息表》，詳見附件），在填開《信息表》時不填寫相對應(yīng)的藍(lán)字專用發(fā)票信息，應(yīng)暫依《信息表》所列增值稅稅額從當(dāng)期進(jìn)項(xiàng)稅額中轉(zhuǎn)出，待取得銷售方開具的紅字專用發(fā)票后，與《信息表》一并作為記賬憑證。 
  購買方取得專用發(fā)票未用于申報抵扣、但發(fā)票聯(lián)或抵扣聯(lián)無法退回的，購買方填開《信息表》時應(yīng)填寫相對應(yīng)的藍(lán)字專用發(fā)票信息。 
  銷售方開具專用發(fā)票尚未交付購買方，以及購買方未用于申報抵扣并將發(fā)票聯(lián)及抵扣聯(lián)退回的，銷售方可在新系統(tǒng)中填開并上傳《信息表》。銷售方填開《信息表》時應(yīng)填寫相對應(yīng)的藍(lán)字專用發(fā)票信息。 
  （二）主管稅務(wù)機(jī)關(guān)通過網(wǎng)絡(luò)接收納稅人上傳的《信息表》，系統(tǒng)自動校驗(yàn)通過后，生成帶有“紅字發(fā)票信息表編號”的《信息表》，并將信息同步至納稅人端系統(tǒng)中。 
  （三）銷售方憑稅務(wù)機(jī)關(guān)系統(tǒng)校驗(yàn)通過的《信息表》開具紅字專用發(fā)票，在新系統(tǒng)中以銷項(xiàng)負(fù)數(shù)開具。紅字專用發(fā)票應(yīng)與《信息表》一一對應(yīng)。 
  （四）納稅人也可憑《信息表》電子信息或紙質(zhì)資料到稅務(wù)機(jī)關(guān)對《信息表》內(nèi)容進(jìn)行系統(tǒng)校驗(yàn)。 
  二、稅務(wù)機(jī)關(guān)為小規(guī)模納稅人代開專用發(fā)票，需要開具紅字專用發(fā)票的，按照一般納稅人開具紅字專用發(fā)票的方法處理。 
  三、納稅人需要開具紅字增值稅普通發(fā)票的，可以在所對應(yīng)的藍(lán)字發(fā)票金額范圍內(nèi)開具多份紅字發(fā)票。紅字機(jī)動車銷售統(tǒng)一發(fā)票需與原藍(lán)字機(jī)動車銷售統(tǒng)一發(fā)票一一對應(yīng)。 
  四、按照《國家稅務(wù)總局關(guān)于納稅人認(rèn)定或登記為一般納稅人前進(jìn)項(xiàng)稅額抵扣問題的公告》（國家稅務(wù)總局公告2015年第59號）的規(guī)定，需要開具紅字專用發(fā)票的，按照本公告規(guī)定執(zhí)行。 
  五、本公告自2016年8月1日起施行，《國家稅務(wù)總局關(guān)于推行增值稅發(fā)票系統(tǒng)升級版有關(guān)問題的公告》（國家稅務(wù)總局公告2014年第73號）第四條、附件1、附件2和《國家稅務(wù)總局關(guān)于全面推行增值稅發(fā)票系統(tǒng)升級版有關(guān)問題的公告》（國家稅務(wù)總局公告2015年第19號）第五條、附件1、附件2同時廢止。此前未處理的事項(xiàng)，按照本公告規(guī)定執(zhí)行。 
  特此公告。 
   
  附件：開具紅字增值稅專用發(fā)票信息表   
國家稅務(wù)總局 
2016年7月20日