會計上，執行《民間非營利組織會計制度》，有點近似事業單位會計制度，科目分類是資產、負債、凈資產、收入、支出，會計科目也與企業會計準則略有區別（民非組織會計制度可以網上下載）。財務處理上，重點有（與企業會計區別較大的地方）：1）沒有實收資本，收到的投資或捐助款，直接計入對應的收入科目，主要有，捐贈收入、會費收入、政府補助收入、提供服務收入、商品銷售收入、投資收益、其他收入等。2）支出沒有那么細的分類，與業務相關的都計入“業務活動成本”；與管理相關的都計入“管理費用”（可設置明細科目）；“財務費用”科目在民非機構中稱為“籌資費用”；不好判斷的支出都計入“其他費用”。3）期末結轉凈資產。凈資產分為“非限定性凈資產”和“限定性凈資產”，收到的貨幣如果指定用途的即為“限定性”，其他都是“非限定性”。結轉分錄借：非限定性凈資產       貸：業務活動成本 / 管理費用 等借：捐贈收入 / 會費收入 / 提供服務收入 等       貸：非限定性凈資產其他科目，與企業會計準則的記賬原則和使用都一樣。報表也是用民間非營利組織會計報表，有資產負債表、業務活動表、現金流量表。民間非營利組織如果交稅，是營業稅。除了經營性收入（服務收入和銷售產品收入）外，捐贈、會費、政府補助等收入都是免稅的。到稅務機關（地稅）申請免稅項目。會費收據到財政申領。