你這種情況  B公司屬于A公司的供應商，C公司是A公司的客戶，這個就是我們平時所說的三流不一致，這種情況最好少發生，如果已經發生了  首先要簽訂三方協議 以后要杜絕

三流不一致的風險你要知道：
1、我們平時說三流一直是要資金流（銀行的收付款憑證）、票流（發票的開票人和收票人）和物流（或勞務流）相互統一，即收款方、開票方和貨物銷售方或勞務提供方必須是同一個法律主體，而且付款方、貨物采購方或勞務接收方必須是同一個法律主體，如果三流不一致，將不能對稅款進行抵扣。
2、合同中應當約定由供應方提供其發出貨物的出庫憑證及相應的物流運輸信息。如果貨物由供應方指定的第三方發出，為了避免三流不一致、導致虛開發票的行為，需要明確供應方提供與第三方之間的采購合同等資料。
  3、對于委托第三方支付和收款等三流不一致的情形，可以通過簽訂三方合同的方式減少風險，或者也可通過約定由第三方付款的方式來解決，但需要提供相應委托協議，以防止被認定為虛開增值稅專用發票的行為。當然，在實際簽訂合同時仍需要根具體情況進行設定。
  4、對于分批交貨合同增值稅專用發票的開具，為了做到三流一致，防止出現虛開增值稅專用發票的情形，應當在合同中約定在收貨當期開具該批次貨物的增值稅專用發票。（注：涉及到分期付款的，基于防范虛開增值稅發票風險考慮，在需方實際收到供方的貨物時，供方產生開具增值稅專用發票的義務。如果貨物不是分期交付，則分期付款行為并不會影響增值稅專用發票的開具。）

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