第一、醫(yī)院不是用非盈利組織會(huì)計(jì)做賬的，是用《醫(yī)院會(huì)計(jì)制度》報(bào)表跟一般企業(yè)的報(bào)表不一樣的，具體名稱：《資產(chǎn)負(fù)債表》、《收入費(fèi)用總表》、《醫(yī)院收入費(fèi)用明細(xì)表》、《現(xiàn)金流量表》、《財(cái)政補(bǔ)助收支情況表》。 
第二，免稅不免稅，是要看具體規(guī)定的。稅管員說(shuō)你沒(méi)有按照非營(yíng)業(yè)組織記賬可能就看你報(bào)表是一般企業(yè)報(bào)表所以就知道你沒(méi)有按照適用的會(huì)計(jì)制度做賬。 

另外：如果你們是用《民間非營(yíng)業(yè)組織會(huì)計(jì)制度》做賬的，也是有專門的報(bào)表名稱的，里面的科目也是有點(diǎn)跟平常的企業(yè)不一樣。
一、結(jié)轉(zhuǎn)會(huì)計(jì)分錄方法如下：
1、在期末將當(dāng)期非限定性收入的實(shí)際發(fā)生額、當(dāng)期費(fèi)用的實(shí)際發(fā)生額和當(dāng)期由限定性凈資產(chǎn)轉(zhuǎn)為非限定性凈資產(chǎn)的金額轉(zhuǎn)入非限定性凈資產(chǎn)。

2、非限定性凈資產(chǎn)處理如下：
  ● 期末，將各收入類科目所屬“非限定性收入”明細(xì)科目的余額轉(zhuǎn)入本科目，借記“捐贈(zèng)收入、會(huì)費(fèi)收入、提供服務(wù)收入、政府補(bǔ)助收入、商品銷售收入、投資收益入、其他收入轉(zhuǎn)入非限定性收入”科目，貸記本科目。
  ● 同時(shí)，將各費(fèi)用類科目的余額轉(zhuǎn)入本科目，借記本科目，貸記“業(yè)務(wù)活動(dòng)成本”、“管理費(fèi)用”、“籌資費(fèi)用”、“其他費(fèi)用”科目。
  ● 如果限定性凈資產(chǎn)的限制已經(jīng)解除，應(yīng)當(dāng)對(duì)凈資產(chǎn)進(jìn)行重新分類，將限定性凈資產(chǎn)轉(zhuǎn)為非限定性凈資產(chǎn)，借記“限定性凈資產(chǎn)”科目，貸記本科目。
  ● 如果因調(diào)整以前期間收入、費(fèi)用項(xiàng)目而涉及調(diào)整非限定性凈資產(chǎn)的，應(yīng)當(dāng)就需要調(diào)整的金額，借記或貸記有關(guān)科目，貸記或借記本科目。
  ● 本科目期末貸方余額，反映民間非營(yíng)利組織歷年積存的非限定性凈資產(chǎn)。

2、限定性凈資產(chǎn)的主要賬務(wù)處理如下：

（一）期末，將各收入類科目所屬“限定性收入”明細(xì)科目的余額轉(zhuǎn)入本科目，借記“捐贈(zèng)收入——限定性收入”、“政府補(bǔ)助收入——限定性收入”等科目，貸記本科目。
（二）如果限定性凈資產(chǎn)的限制已經(jīng)解除，應(yīng)當(dāng)對(duì)凈資產(chǎn)進(jìn)行重新分類，將限定性凈資產(chǎn)轉(zhuǎn)為非限定性凈資產(chǎn)，借記本科目，貸記“非限定性凈資產(chǎn)”科目。
如果資產(chǎn)提供者或者國(guó)家有關(guān)法律、行政法規(guī)要求民間非營(yíng)利組織在特定時(shí)期之內(nèi)或特定日期之后將限定性凈資產(chǎn)或者相關(guān)資產(chǎn)用于特定用途，該限定性凈資產(chǎn)應(yīng)當(dāng)在相應(yīng)期間之內(nèi)或相應(yīng)日期之后按照實(shí)際使用的相關(guān)資產(chǎn)金額或者實(shí)際發(fā)生的相關(guān)費(fèi)用金額轉(zhuǎn)為非限定性凈資產(chǎn)。
（三）如果因調(diào)整以前期間收入、費(fèi)用項(xiàng)目而涉及調(diào)整限定性凈資產(chǎn)的，應(yīng)當(dāng)就需要調(diào)整的金額，借記或貸記有關(guān)科目，貸記或借記本科目。
（四）本科目期末貸方余額，反映民間非營(yíng)利組織歷年積存的限定性凈資產(chǎn)。