學員你好， 
這個看你和對方的約定。 
比如你公司，如果一共收對方10萬元，那你開10萬的管理費用發票應該含稅，不含稅金額為10/1.06，稅額為10/1.06*6%，二者合計為10萬。 
如果你公司增值稅另收的話，一共要收取對方10萬+10*6%=10.6萬元，不含稅金額為10萬，稅額為0.6萬。 
這個增值稅你公司開專票，對方是可以抵扣進項稅的。