如果您的公司是一般納稅人，且土地是在2016年5月1日后購買的，那么在土地被拍賣后，需要根據相關稅收法規規定，繳納相應的增值稅。
具體而言，根據中國的稅收法規，增值稅是由賣方負責繳納的，因此在這種情況下，應該由您的公司負責繳納拍賣所得的增值稅。
如果您未能按時繳納增值稅，可能會面臨稅務滯納金或罰款等處罰措施。因此，建議您盡快與稅務部門聯系，了解具體的納稅程序和要求，并按照規定及時繳納增值稅，以避免可能的稅務風險。